De Geertruidskerk is eigendom van de Protestantse gemeente te Geertruidenberg (PGG), die daarnaast ook de kerk aan de Emmastraat in Raamsdonksveer bezit. De Geertruidskerk wordt 12 keer per jaar gebruikt voor reguliere zondagse erediensten. De PGG wil de Geertruidskerk weer een centrale plaats geven in de samenleving, maar ook inzetten voor  Het grote kerkgedeelte heeft zo'n 250 zitplaatsen, maar ook het koor (voor in de kerk op de verhoging) zijn er mogelijkheden voor wat kleinschalige activiteiten. Daarnaast biedt de crypte ook een sfeervolle ambiance voor concerten, verlovingsfeesten, vergaderingen en presentaties. Echter ook voor een opbaring is dit een intieme ruimte. Ook de zogenaamde winterkerk biedt vergaderingen, presentaties, voorlichtingsbijeenkomsten en nog veel meer. 

De Geertruidskerk hoort bij de Protestantse gemeente te Geertruidenberg, die ook een kerkgebouw heeft aan de Emmastraat in Raamsdonksveer. Het beheer van de kerk wordt nu uitgevoerd door een exploitatiecommissie die ondersteund wordt door vele vrijwilligers.